Sitt ordningsnummer till trots är Logen nr 3 Amicitia den första helt svenska Odd Fellow-logen. Logerna nr 1 Scania och nr 2 Veritas, båda startade några år tidigare, stod nämligen vid den tiden under dansk jurisdiktion.

Amicitia-Klubben
I december 1887 beslöt fem bröder i Logen nr 1 Scania att gemensamt begära avgångsbrev från sin Loge för att bilda en Odd Fellow-klubb med namnet Amicitia. Klubbens första uppgift blev att inge en petition om fribrev för Odd Fellow-logen nr 3 Amicitia IOOF av Sverige. Petitionen sändes till Stormästaren i den danska Storlogen, justitierådet Andreas Holk, med anhållan om att han med sitt förord skulle vidarebefordra denna till Suveräna Storlogen i Amerika. Petitionen behandlades där snabbt och redan i mars 1888 kunde Stormästaren br Andreas Holk meddela att han erhållit det efterfrågade fribrevet vilket han, i avvaktan på Logens instituering, skulle förvara.

Logen nr 3 Amicitia
I närvaro av representanter för Logerna nr 1 Scania, nr 2 Veritas, samtliga danska Loger och en broder från Logen Bertel Torvaldsen i New York instituerades Logen nr 3 Amicitia den 1 augusti 1888 av DSSS konsul J Rath från Köpenhamn biträdd av Storsekreteraren Johan Hansen. Fribrevet, utfärdat av Suveräna Storlogen i Columbus Ohio den 27 januari 1888, jämte ritualer och andra handlingar överlämnades varefter Logens valda Ämbetsmän installerades. Till ÖM hade br J F Mårtensson utsetts, till UM br E C Lembke, till PS br E A Gyllenberg, till FS br C A Olsson och till SkM br C F Jörgensen samtliga tillhörande den grupp av bröder som knappt ett år tidigare begärt avgångsbrev från Logen nr 1 Scania.

Under presidium av Ämbetsmän från Logen nr 1 Scania upptogs 10 klubbmedlemmar som tidigare inte var Odd Fellow-bröder i Invigningsgraden. Vid sin start hade Logen alltså totalt 15 medlemmar.

Den nybildade Logen var nu direkt underställd Suveräna Storlogen i Amerika vilket innebar språkproblem och en del andra olägenheter. T.ex. måste all korrespondens ske på engelska, ritualer och stadgar måste översättas, resebrev krävdes för Amicitia-bröder vid besök i Logerna nr 1 Scania och nr 2 Veritas som tillhörde den danska Storlogen mm. Även om en del anpassningar och förenklingar gjordes, bl.a. genom att ÖM br E A Gyllenberg 1889 utsågs till DSSS i Sverige och därmed ersatte den danske Stormästaren, kvarstod problemen ända fram till 1894 då den svenska Storlogen bildades.

Dessförinnan tog DSSS E A Gyllenbergs initiativet till inrättandet av lägerklubb som föreningsband logerna emellan och i oktober 1891 instituerades Lägret nr 1 Suecia likaledes underställt Suveräna Storlogen. Andra Amicitia-bröder, Sigfrid Herrström och N A Ewald tog initiativ att bilda Logerna nr 4 John Ericsson i Stockholm resp. nr 5 Concordia i Eslöv.

Sedan ytterligare en Loge, nr 6 Holmia i Stockholm, tillkommit i mars 1894, var kravet på minst fem Loger för inrättande av en svensk Storloge uppfyllt. Med god hjälp av den speciellt deputerade storsiren för Europa, Herman Block, och efter att den danska Storlogen avstått från att verka för bildande av en skandinavisk storloge, utfärdade Suveräna Storlogen fribrev med vissa inskränkningar för en svensk Storloge som därefter kunde instituerades i juli 1895. Efter ytterligare två år blev den svenska Storlogen helt oberoende.